[PŘÍBĚH NARUTO: ALTERVERSE]

Představme si, že Uchiha Madara nikdy nepřežil tak dlouho, aby dokázal ovlivnit novou generaci světa shinobi. Spousta věcí, která se udála, se udála trochu jinak, nebo dokonce nikoliv. Začněme tam, kde se naše herní prostředí bude odehrávat - Konohagakure no Sato.

Godaime no Uchiha
V tuto chvíli v Konohagakure no Sato vládne po incidentu s devítiocasým démonem a odchodem Yondaime Hokageho do ústraní. Godaime Hokage, Obito Uchiha, který díky svým zásluhám ve Velké válce ninjů prokázal své schopnosti - a ačkoliv se stal známým jako jednooký Uchiha, na jeho schopnostech tento fakt rozhodně neubírá. Jeho druhý sharingan věnoval během Velké války ninjů svému příteli, Hatake Kakashimu, ve víře, že svá zranění nepřežije. Uchiha Obito se však o několik měsíců znovu ukázal v plné síle a plně rozvinutým sharinganem. Společně s Kakashim následně překazili plán Kirigakure no Sato zapečetit Sanbiho do jeho lásky, Rin, a zničit tak Konohagakure no Sato zevnitř.

Kyubi no Kaiho
Těhotenství Uzumaki Kushiny výrazně oslabilo pečeť, která během porodu povolila úplně a devítiocasý démon tak mohl přinést zkázu na Vesnici skrytou v Listí. Tato katastrofa přinesla Konoze ztráty v podobě smrti posledního Jinchurikiho, Uzumaki Kushiny, ale zároveň také jejího syna, Uzumaki Naruta. Yondaime Hokage, Namikaze Minato, se po těchto událostech uchýlil do ústraní. Stále sídlí v Konohagakure no Sato jako záložní síla, avšak již neúřaduje jako Hokage, tuto pozici zastává jeho žák, Uchiha Obito.

Uchiha no Seizon
Díky obsazením místa Hokageho zástupcem z řady Uchihů, byť snad nejmladším Hokagem v historii světa shinobi, navíc nedošlo k vyvraždění klanu Uchiha, jelikož klan Uchiha neplánoval žádný převrat - získali svůj podíl na moci a zlomili tak doktrínu, kterou Tobirama Senju, Niidaime Hokage, stanovil. Tímto stále nejznámější zástupci klanu Uchiha jako například Uchiha Itachi, Uchiha Shisui a Uchiha Fugaku, stále žijí. Uchiha Itachi byl Sandaimem přeložen z ANBU k ANBU Root, aby dohlížel na aktivity Staršího Danza, Uchiha Shisui se po válce usadil a založil rodinu.

Amegakure no Akatsuki
Akatsuki zůstává osvobozeneckou organizací v Amegakure no Sato se třemi hlavními postavami v čele - Konan, Nagato, Yahiko.
Tři sirotci, nad kterými se Jiraiya slitoval a aby je zachránil před smrtí Orochimarovo rukou, naučil je se o sebe postarat. Nagato nikdy nezískal Rinnegan a proto se jeho zaměření ubrala jiným směrem. Směrem k pečetícím technikám, které díky jeho původu nabírají značných sil. Přesné cíle Akatsuki nejsou známé a její konflikt s Hanzo Salamandrem je stále v dění.

Nichibotsu
Na druhou stranu se zde objevuje nová organizace, která shromažďuje silné shinobi, kteří již nemají zájem o spolupráci s velkými vesnicemi, které je chtějí pouze svázat a ovládat. Tato organizace se jmenuje Nichibotsu, nikdo netuší, kde sídlí, kdo ji ovládá, kolik má členů a co plánují. Skrze země pouze kolují zvěsti a řeči o mocné organizaci, která neplánuje nic dobrého pro svět, jak ho známe.

Densetsu no Sannin: Orochimaru, Tsunade, Jiraiya
Orochimaru zůstává věrný svému plánu zničit Konohagakure no Sato - vyvinul převtělovací techniku, pomocí které se snaží získat legendární Sharingan, se kterým by se jeho potenciál génia několikanásobně zvětšil. A zničení Konohy by tak bylo o to blíž. Orochimaru založil Otogakure no Sato a ačkoliv funguje jako její pravý Otokage, je stínem až doslovným. Jako Otokageho dosadil osobu známou pouze jako Guren Miyajima.

Tsunade, i přes svůj vznešený původ jakožto vnučka Prvního Hokageho, nikdy nepotkala naději, díky které by se vzdala své závislosti na sázení, alkoholu a jiných neřestech. Zároveň se nikdy nestala Godaime Hokage, i přes Jiraiyův návrh před Staršími. Starší se však usnesli, že není vhodné, aby se Hokagem stal opilec, jelikož něco takového by vrhalo stín na úsudek všech zodpovědných za chod Hi no Kuni, Země Ohně. Tsunade tedy stále cestuje mezi vesnicemi po území Země Ohně a obrovské bohatství klanu Senju prohrává v jedné sázce za druhou.

Jiraiya zůstal stejný, avšak stále hledá své Dítě proroctví, které doposud nebyl schopný nalézt. Jediní studenti, které kdy naučil co znal byl Nagato a Minato - kde Nagato byl válečný sirotek, kterého nemohl nechat napospas smrti, ze kterého se následně stal rebel v Amegakure no Sato, a kde Minato byl nadějný mladík s obrovským potenciálem, kterého ale zničila shoda okolností a krutost osudu poté, co jeho životní láska a jeho první syn tragicky zemřeli při útoku Kyubi no Youkou.